Program Studi Kedokteran UIN Walisongo Semarang bertujuan menghasilkan dokter profesional yang mampu menjawab tantangan kesehatan di masyarakat secara dinamis, beretika, dan berwawasan kedokteran regeneratif serta sistem penjaminan kesehatan. Lulusan dipersiapkan untuk berkiprah pada tingkat lokal, nasional, hingga internasional sesuai Standar Kompetensi Dokter Indonesia.
Profil lulusan mengacu pada konsep Five Stars Doctor, yaitu:

• Care Provider (Penyedia Pelayanan Kesehatan) Memberikan pelayanan kesehatan optimal berlandaskan tata nilai Fakultas, khususnya dalam mendukung perubahan gaya hidup pada penyakit degeneratif seperti diabetes mellitus.
• Decision Maker (Pengambil Keputusan) Mampu mengambil keputusan tatalaksana pasien secara cepat, tepat, dan komprehensif, terutama terkait pengelolaan penyakit degeneratif.
• Communicator (Komunikator) Mampu berkomunikasi efektif dengan pasien dan masyarakat dalam upaya meningkatkan kesadaran perubahan gaya hidup sehat.
• Community Leader (Pemimpin Masyarakat) Memiliki jiwa kepemimpinan dan mampu berkolaborasi dalam tim maupun masyarakat dalam upaya penguatan kesehatan publik.
• Manager (Pengelola Manajemen Kesehatan) Mampu menciptakan sistem pengelolaan kesehatan yang efektif dan efisien, khususnya dalam pengendalian penyakit degeneratif seperti diabetes mellitus.